日本インドネシア学会は、会長、監査委員、事務局委員3名（総務担当、学会誌担当、会計担当）の役員と毎年交代する当番校の担当者が協力して、毎年、研究大会と会員総会を開催している。

Struktur organisasi HPISJ terdiri dari : Ketua, Pengawas, Sekretariat (Urusan Umum, Urusan Jurnal, Urusan Kas Iuran). Pengurus juga bekerjasama dengan petugas dari Akademi/Universitas yang bergantian setiap tahun untuk melaksanakan simposium dan rapat umum anggota.

本学会の会員は、インドネシアを中心とした言語、文化、文学等に関する研究の発展および会員相互の協力を促進する目的を達成するために、①機関誌の発行；②研究発表のための大会の準備；③会員総会の開催；④会員への連絡および協力促進；⑤その他必要な事業を行うことに賛同する人を会員としている。

Anggota HPISJ adalah mereka yang menyetujui :

penerbitan jurnal HPISJ
persiapan untuk simposium presentasi makalah
pelaksanaan rapat umum anggota
meningkatkan kerjasama dan menghubungi anggota
melaksanakan kegiatan lainnya yang dirasakan penting
guna mencapai tujuan bersama untuk meningkatkan kerjasama antar anggota dan mengembangkan penelitian mengenai Indonesia dalam bidang bahasa, kebudayaan, kesusastraan dan lain-lain.

入会資格、大会（総会および研究発表）への参加、機関誌への投稿、会費等についての詳細は「日本インドネシア学会会則」を参照されたい。

Syarat menjadi anggota, keikutsertaan dalam simposium (rapat umum anggota dan presentasi makalah), penulisan artikel dalam jurnal, iuran anggota dan lain-lain akan dibahas secara mendetail pada “Peraturan Keanggotaan HPIS”.